La médecine traditionnelle est très sollicitée par la population de la commune à travers ses 23 Centres thérapeutiques. Dans ce secteur, six problèmes ont été, de façon consensuelle, retenus comme prioritaires par les populations de la commune de Sèmè-Podji. Il s'agit de :

• l'insuffisance de personnel qualifié ;
• l'insuffisance d'infrastructures et équipements sanitaires ;
• l'insuffisance d'équipement et de matériel de travail adéquats ;
• la faible fréquentation des centres de santé par les autochtones ;
• l'inexistence de clôture pour les CSA d'Agblangandan, de Djèrègbé, de Sèkandji et du CPS ;
• la prolifération des cabinets privés non autorisés.

Au regard des normes admises sur le plan national, la population de la Commune de Sèmè­Podji bénéficie d'un encadrement sanitaire suffisant. Cependant, il faut reconnaître que ces chiffres ne traduisent pas la réalité, lorsqu'on sait que les formations sanitaires publiques ne disposent que d'un seul médecin. Les autres médecins, pour la plupart des spécialistes n'interviennent que dans des cabinets privés très peu fréquentés par la population. A cause des soins médicaux spécialisés onéreux qu'offrent ces cabinets.
Quant aux infirmiers bien que leur nombre dépasse largement l'effectif nécessaire pour assurer l'encadrement de la population, cette dernière affirme que ses besoins ne sont pas satisfaits. En effet sur les 46 infirmiers intervenant dans la Commune, seulement 25 sont actifs dans les centres publics.
Par contre pour les sages femmes au delà du fait que la norme (une sage femme pour 5000 femmes en âge de procréer) est largement dépassée, on note que 84% des sages femmes (soit 16 sur 19) relève du secteur public et sont donc accessible à la population.